水池发绿的主要原因不是细菌而是藻类，水质污染后水质情况复杂，同时，池塘会随着季节的改变而不断变化，花园鱼池的污染来源于有机物的氧化代谢物，
水里的磷酸盐及含氮废物的增高给藻类大规模繁殖提供了充足营养使藻类爆发。
当它们白天生长的时候，藻类制造氧气释放到水中，夜晚，藻类和植物消耗氧气并向水中释放二氧化碳。几天到几周后，藻类死亡并沉到池塘的底部。在到达池塘底部的途中和池塘底部本身，浮游生物和微生物（细菌和真菌）使藻类进行新陈代谢。
这些生物仅重新构建了小部分营养物，氮和磷在它们自己的生物中，其余的释放到了周围的水中。导致鱼类和其他水生物窒息。毕竟，花园池塘自身调节生态平衡的能力有限。
解决的办法，除了换水外之外，可以减少饵料的投放，特别是在气温高的时候，有条件的要加潜水泵加快有机质的降解速度，在水池中加喷淋或假山瀑布，给硝化细菌提供工作场所，使硝化细菌把有毒的亚硝酸盐分解成低毒的硝酸盐。
这样在一定程度上，大大减缓了池塘压力，但是想长期保证水清那是远远不够的。
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