藻蓝蛋白是一种天然的色素蛋白，可广泛应用于食品添加剂、化妆品着色剂，目前自然界中天然蓝色色素很稀缺，是欧盟食品中*允许使用的蓝色色素。也是美国FDA允许的*天然蓝色色素。并在生化细胞学研究领域有着重要的作用，完全没有副作用并具有丰富的营养价值，所有它的开发价值及应用价值非常大，未来具有爆发性增长潜能。
此前，如果想在食物里加点蓝颜色，那么可能需要人工合成的颜料才能够做到。不过，这种颜料并不是所有人都喜欢，甚至对一些人来说还会引起过敏反应。
蓝色在自然界中十分稀有的色调，原因是大部分的"蓝色"都是光线散射的结果。而非色素本身的颜色。
例如，蓝色的眼睛事实上是由于光线中的蓝色部分散射进入角膜中造成的视觉假象，蓝色蝴蝶的翅膀则是由于空气中细小的灰尘反射光线后引起的颜色变化。甚至蓝莓中的蓝色都是一种紫色颜料造成的。
藻蓝蛋白又被称为"副色素"，它是一个蛋白的复合体，能够与叶绿素结合吸收光照，并将能量以葡萄糖的形式储存在机体内。
由于该色素对人体无害而又水溶性高，因此可以作为一种食物增色剂。
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